BRCA1，BRCA2 遺伝子に生殖細胞系列変異があれば，女性は乳癌を発症しやすくなる．BRCA1 変異は，若年性乳癌の女性の約 12%に認められ，アデニンおよびグアニンの欠失を引き起す特異的変異（185delAG）は，アシュケナジユダヤ人集団の 1%に存在し，若いユダヤ人女性の乳癌の 21%に寄与している．BRCA2 変異の若年性乳癌に対する寄与はわかっていない．

32 歳までに乳癌と診断された女性 73 人から得たリンパ球標本を，相補的 DNA に基づく蛋白切断測定法を行った後，自動ヌクレオチド配列決定によって BRCA2 のヘテロ接合変異の有無を調べた．さらに，40 歳までに乳癌と診断されたユダヤ人女性 39 人の標本についても，対立遺伝子特異的ポリメラーゼ連鎖反応によって特異的変異を調べた．

明確な BRCA2 変異は，若年性乳癌女性 73 人中 2 人（2.7%，95%信頼区間，0.4～9.6%）に認められ，これは BRCA2 が，BRCA1 よりも乳癌症例が少ないことに関連することを示唆している（p＝0.03）．チミン欠失を引き起す特異的 BRCA2 変異（6174delT）は，アシュケナジユダヤ人集団の 1.3%に検出されたが，乳癌を有する若いユダヤ人女性では 39 人中 1 人（2.6%，95%信頼区間，0.09～13.5%）に認められ，若年性乳癌の危険因子として果たす役割が小さいことを示している．乳癌を有する若い女性では，明確な切断変異とともに，蛋白の最終 C 末端の切断を引き起す BRCA2 変異と，機能的には何も起きない可能性のある BRCA2 変異がある．

BRCA2 のジャームライン変異は，若い女性における乳癌症例が BRCA1 変異よりも少ないことと関連している．BRCA2 変異のキャリアでは，若年性乳癌のリスクの増加がより小さい可能性がある．