Ixodes scapularis マダニに咬傷されたあとに抗菌薬治療を行うことによって，ライム病が予防できるかどうは明らかにされていない．

ライム病の広く蔓延しているニューヨーク州のある地域において，身体に付着していた I. scapularis マダニを，試験開始前の 72 時間以内に駆除した 482 例の被験者を対象として，プラセボを対照とした，ドキシサイクリン 200 mg を単回投与する治療の二重盲検無作為比較試験を実施した．試験開始時と 3 週目および 6 週目に，被験者に面接および検査を行い，血清抗体検査を，Borrelia burgdorferi の血液培養とともに実施した．

マダニ咬傷部位に遊走性紅斑が発現した被験者の割合は，ドキシサイクリン群のほうがプラセボ群よりも有意に少なかった（235 例の被験者のうち 1 例 [0.4%] 対 247 例の被験者のうち 8 例 [3.2%]，p ＜ 0.04）．ドキシサイクリン治療の有効率は 87%であった（95%信頼区間，25 ～ 98%）．ライム病の皮膚以外の他覚的徴候はどの被験者にも発現せず，無症候性のセロコンバージョンもまったく認められなかった．有害作用は，ドキシサイクリンの治療に関連して発現頻度が高くなっていたが（被験者の 30.1%に対し，プラセボでは 11.1%；p ＜ 0.001），その主なものは，悪心（15.4% 対 2.6%）と嘔吐（5.8% 対 1.3%）であった．遊走性紅斑は，予防治療が行われなかった咬傷では，マダニの若虫に咬傷されたときのほうが，雌のマダニの成虫に咬傷されたときよりも発現頻度が高かった（142 件の咬傷のうち 8 件 [5.6%] 対 97 件の咬傷のうち 0 件 [0%]，p = 0.02）．

ライム病は，I. scapularis マダニに咬傷されたあと 72 時間以内にドキシサイクリン 200 mg を単回投与することによって，発症を予防することができる．