標準リスクの急性骨髄性白血病（AML）は分子的に多様であるにもかかわらず，治療決定は限られた数の分子遺伝子マーカーと，形態学的な寛解評価に基づいて行われている．白血病特異的マーカー（ヌクレオフォスミンをコードする遺伝子 [NPM1] の変異など）を高感度で検出できれば，寛解期の超微細な病変を同定できるようになり，予後予測が改善される可能性がある．

英国国立がん研究所の AML17 試験で集中治療を受けた NPM1 変異 AML 患者 346 例の 2,569 検体に対して，微小残存病変を検出するために定量的逆転写酵素ポリメラーゼ連鎖反応（PCR）法を行った．51 遺伝子のカスタムパネルを用いて，診断時に採取された 223 検体と再燃時に採取された 49 検体の標的配列決定を行った．デジタル PCR を用いて，前白血病クローンに関連する変異を追跡した．

分子プロファイリングによって，NPM1 変異 AML の複雑さが浮き彫りになった．患者は 150 を超えるサブグループに分かれ，信頼性の高い転帰予測を妨げていた．微小残存病変の有無から，より多くの予後情報が得られた．化学療法を 2 サイクル施行後，患者の 15%で血中に NPM1 変異転写産物の残存が認められた．そのような患者では，残存が認められなかった患者と比較して，追跡 3 年後の再発リスクがより高く（82% 対 30%，ハザード比 4.80，95%信頼区間 [CI] 2.95～7.80，P＜0.001），生存率がより低かった（24% 対 75%，死亡のハザード比 4.38，95% CI 2.57～7.47，P＜0.001）．微小残存病変の存在は，多変量解析において死亡の唯一の独立した予後因子であった（ハザード比 4.84，95% CI 2.57～9.15，P＜0.001）．これらの結果は，独立したコホートで妥当性が検証された．微小残存病変の連続モニタリングでは，NPM1 変異転写産物の濃度上昇から再発が高い信頼度で予測された．前白血病クローンに関連する変異は，化学療法後の寛解持続中も依然として検出可能であったが，NPM1 変異は再発時に 70 例中 69 例で検出され，より優れた疾患マーカーであることが示された．

微小残存病変の存在は，NPM1 変異転写産物の定量によって決定され，他の危険因子とは独立した強力な予後情報を提供した．（Bloodwise と英国国立健康研究所から研究助成を受けた．Current Controlled Trials 登録番号 ISRCTN55675535）